Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATG4DQ86TL0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms