Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC6BQ86SZ2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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