Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUFY3Q7L099 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUFY3Q7L099 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms