Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BBS12Q6ZW61 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms