Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BEND4Q6ZU67 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms