Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CFAP47Q6ZTR5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CFAP47Q6ZTR5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms