Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
C16orf54Q6UWD8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms