Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC102BQ68D86 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC102BQ68D86 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms