Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SUSD4Q5VX71 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms