Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf135Q5VTT2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms