Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYTL3Q4VX76 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYTL3Q4VX76 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms