Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC153Q494R4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC153Q494R4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms