Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD55Q3KP44 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms