Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HFEQ30201 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HFEQ30201 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HFEQ30201 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HFEQ30201 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HFEQ30201 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HFEQ30201 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HFEQ30201 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HFEQ30201 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HFEQ30201 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HFEQ30201 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HFEQ30201 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HFEQ30201 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HFEQ30201 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HFEQ30201 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HFEQ30201 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HFEQ30201 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HFEQ30201 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HFEQ30201 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms