Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC57Q2TAC2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms