Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ODF4Q2M2E3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF4Q2M2E3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms