Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MICAQ29983 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
MICAQ29983 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MICAQ29983 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MICAQ29983 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MICAQ29983 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MICAQ29983 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MICAQ29983 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MICAQ29983 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms