Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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