Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL24A1Q17RW2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms