Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GEN1Q17RS7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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