Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDO1Q16878 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
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