Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECM1Q16610 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ECM1Q16610 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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ECM1Q16610 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ECM1Q16610 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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