Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SGCBQ16585 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SGCBQ16585 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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