Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC37Q16543 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms