Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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