Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA4Q16363 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA4Q16363 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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