Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD2Q16342 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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