Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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VAMP3Q15836 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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VAMP3Q15836 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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VAMP3Q15836 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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