Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP4Q15650 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIP4Q15650 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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