Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SS18Q15532 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SS18Q15532 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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SS18Q15532 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SS18Q15532 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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