Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
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PTPRKQ15262 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
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PTPRKQ15262 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
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PTPRKQ15262 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRKQ15262 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
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PTPRKQ15262 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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PTPRKQ15262 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
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PTPRKQ15262 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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PTPRKQ15262 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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PTPRKQ15262 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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PTPRKQ15262 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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PTPRKQ15262 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PTPRKQ15262 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
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