Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NCF4Q15080 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NCF4Q15080 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms