Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGEF6Q15052 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARHGEF6Q15052 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms