Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HDM1Q15032 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HDM1Q15032 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms