Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMD6Q15008 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMD6Q15008 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms