Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RAB39AQ14964 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms