Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BECN1Q14457 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BECN1Q14457 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms