Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COL9A3Q14050 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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