Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PDE7AQ13946 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PDE7AQ13946 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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