Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1SQ13698 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms