Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PRPF4BQ13523 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PRPF4BQ13523 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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