Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
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PTGDRQ13258 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTGDRQ13258 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTGDRQ13258 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTGDRQ13258 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTGDRQ13258 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTGDRQ13258 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTGDRQ13258 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTGDRQ13258 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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