Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NME3Q13232 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NME3Q13232 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NME3Q13232 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NME3Q13232 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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