Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDZK1IP1Q13113 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDZK1IP1Q13113 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms