Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAB40BQ12829 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms