Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RASGEF1BQ0VAM2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms