Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMOD3Q0VAK6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms