Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms