Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD300CQ08708 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD300CQ08708 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms