Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TGM3Q08188 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms